Protein–RNA interactions for Protein: Q6TXD4

Dnmbp, Dynamin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DnmbpQ6TXD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DnmbpQ6TXD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
DnmbpQ6TXD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
DnmbpQ6TXD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DnmbpQ6TXD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
DnmbpQ6TXD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
DnmbpQ6TXD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DnmbpQ6TXD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DnmbpQ6TXD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
DnmbpQ6TXD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
DnmbpQ6TXD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DnmbpQ6TXD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
DnmbpQ6TXD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DnmbpQ6TXD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DnmbpQ6TXD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DnmbpQ6TXD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DnmbpQ6TXD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DnmbpQ6TXD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
DnmbpQ6TXD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
DnmbpQ6TXD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms