Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc189Q6NZQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc189Q6NZQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc189Q6NZQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc189Q6NZQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc189Q6NZQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc189Q6NZQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc189Q6NZQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc189Q6NZQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc189Q6NZQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc189Q6NZQ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms