Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Secisbp2lQ6A098 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Secisbp2lQ6A098 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Secisbp2lQ6A098 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Secisbp2lQ6A098 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Secisbp2lQ6A098 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Secisbp2lQ6A098 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Secisbp2lQ6A098 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Secisbp2lQ6A098 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Secisbp2lQ6A098 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Secisbp2lQ6A098 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms