Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Knl1Q66JQ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Knl1Q66JQ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Knl1Q66JQ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Knl1Q66JQ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Knl1Q66JQ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Knl1Q66JQ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Knl1Q66JQ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Knl1Q66JQ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Knl1Q66JQ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Knl1Q66JQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Knl1Q66JQ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Knl1Q66JQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Knl1Q66JQ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Knl1Q66JQ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Knl1Q66JQ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Knl1Q66JQ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Knl1Q66JQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Knl1Q66JQ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Knl1Q66JQ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Knl1Q66JQ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Knl1Q66JQ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Knl1Q66JQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms