Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms