Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Znrf3Q5SSZ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Znrf3Q5SSZ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Znrf3Q5SSZ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Znrf3Q5SSZ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Znrf3Q5SSZ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Znrf3Q5SSZ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Znrf3Q5SSZ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Znrf3Q5SSZ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Znrf3Q5SSZ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Znrf3Q5SSZ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Znrf3Q5SSZ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znrf3Q5SSZ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znrf3Q5SSZ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znrf3Q5SSZ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Znrf3Q5SSZ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Znrf3Q5SSZ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znrf3Q5SSZ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znrf3Q5SSZ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Znrf3Q5SSZ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Znrf3Q5SSZ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Znrf3Q5SSZ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Znrf3Q5SSZ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Znrf3Q5SSZ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znrf3Q5SSZ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znrf3Q5SSZ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Znrf3Q5SSZ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Znrf3Q5SSZ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Znrf3Q5SSZ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Znrf3Q5SSZ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Znrf3Q5SSZ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Znrf3Q5SSZ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Znrf3Q5SSZ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Znrf3Q5SSZ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Znrf3Q5SSZ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Znrf3Q5SSZ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Znrf3Q5SSZ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znrf3Q5SSZ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Znrf3Q5SSZ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Znrf3Q5SSZ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Znrf3Q5SSZ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Znrf3Q5SSZ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Znrf3Q5SSZ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Znrf3Q5SSZ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Znrf3Q5SSZ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Znrf3Q5SSZ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Znrf3Q5SSZ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Znrf3Q5SSZ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Znrf3Q5SSZ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Znrf3Q5SSZ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Znrf3Q5SSZ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Znrf3Q5SSZ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Znrf3Q5SSZ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Znrf3Q5SSZ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Znrf3Q5SSZ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Znrf3Q5SSZ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Znrf3Q5SSZ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Znrf3Q5SSZ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Znrf3Q5SSZ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znrf3Q5SSZ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znrf3Q5SSZ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znrf3Q5SSZ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Znrf3Q5SSZ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znrf3Q5SSZ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znrf3Q5SSZ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Znrf3Q5SSZ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znrf3Q5SSZ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znrf3Q5SSZ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Znrf3Q5SSZ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znrf3Q5SSZ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Znrf3Q5SSZ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znrf3Q5SSZ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znrf3Q5SSZ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znrf3Q5SSZ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znrf3Q5SSZ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znrf3Q5SSZ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znrf3Q5SSZ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znrf3Q5SSZ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Znrf3Q5SSZ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znrf3Q5SSZ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znrf3Q5SSZ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znrf3Q5SSZ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znrf3Q5SSZ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znrf3Q5SSZ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znrf3Q5SSZ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znrf3Q5SSZ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znrf3Q5SSZ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znrf3Q5SSZ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms