Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo39Q5NBU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo39Q5NBU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo39Q5NBU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo39Q5NBU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo39Q5NBU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo39Q5NBU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo39Q5NBU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms