Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6899Q3USS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6899Q3USS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6899Q3USS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6899Q3USS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm6899Q3USS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm6899Q3USS0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm6899Q3USS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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