Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Parp3Q3ULW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Parp3Q3ULW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Parp3Q3ULW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp3Q3ULW8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Parp3Q3ULW8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp3Q3ULW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Parp3Q3ULW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp3Q3ULW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp3Q3ULW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms