Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc33Q3ULW6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc33Q3ULW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc33Q3ULW6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc33Q3ULW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc33Q3ULW6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms