Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tnrc6cQ3UHC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tnrc6cQ3UHC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tnrc6cQ3UHC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Tnrc6cQ3UHC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnrc6cQ3UHC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tnrc6cQ3UHC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tnrc6cQ3UHC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tnrc6cQ3UHC0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tnrc6cQ3UHC0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tnrc6cQ3UHC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms