Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef3Q3UGY8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef3Q3UGY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arfgef3Q3UGY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef3Q3UGY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef3Q3UGY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef3Q3UGY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms