Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttll12Q3UDE2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttll12Q3UDE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttll12Q3UDE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttll12Q3UDE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttll12Q3UDE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ttll12Q3UDE2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ttll12Q3UDE2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttll12Q3UDE2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttll12Q3UDE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms