Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdkl4Q3TZA2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkl4Q3TZA2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkl4Q3TZA2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdkl4Q3TZA2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl4Q3TZA2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkl4Q3TZA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdkl4Q3TZA2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdkl4Q3TZA2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms