Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trmt1Q3TX08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trmt1Q3TX08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trmt1Q3TX08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt1Q3TX08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trmt1Q3TX08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt1Q3TX08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trmt1Q3TX08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trmt1Q3TX08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trmt1Q3TX08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms