Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 SED1YDR077W 1017 nt10.17□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 YJL055WYJL055W 738 nt10.16□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 YJR114WYJR114W 393 nt10.16□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 SPT20YOL148C 1815 nt10.15□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 SAM35YHR083W 990 nt10.15□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 TAF13YML098W 504 nt10.13□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 SLG1YOR008C 1137 nt10.13□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 THI72YOR192C 1800 nt10.09□□□□□ -0.79
RTP1Q12751 RPC82YPR190C 1965 nt10.08□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 RIB1YBL033C 1038 nt10.07□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 LIP1YMR298W 453 nt10.07□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 PAR32YDL173W 888 nt10.04□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 LSB5YCL034W 1065 nt10.04□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 HEL2YDR266C 1920 nt10.03□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 CSM1YCR086W 573 nt10.03□□□□□ -0.8
RTP1Q12751 TIP1YBR067C 633 nt10.02□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.01□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 INA1YLR413W 2028 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 YJL118WYJL118W 660 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 YMR262WYMR262W 942 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 YPL251WYPL251W 303 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 RIB7YBR153W 735 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 GAL3YDR009W 1563 nt10□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 PRM5YIL117C 957 nt9.99□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 MEP3YPR138C 1470 nt9.98□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 YIA6YIL006W 1122 nt9.98□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 ERG6YML008C 1152 nt9.98□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 HIF1YLL022C 1158 nt9.97□□□□□ -0.81
RTP1Q12751 SOD2YHR008C 702 nt9.96□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 NUC1YJL208C 990 nt9.96□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 GSF2YML048W 1212 nt9.96□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 BRR1YPR057W 1026 nt9.96□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 RPT5YOR117W 1305 nt9.96□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 YMR103CYMR103C 363 nt9.95□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 MHF1YOL086W-A 273 nt9.95□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 LEU9YOR108W 1815 nt9.95□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 DBP1YPL119C 1854 nt9.94□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 TUB4YLR212C 1422 nt9.93□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 YBL086CYBL086C 1401 nt9.93□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 POT1YIL160C 1254 nt9.93□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 SNZ1YMR096W 894 nt9.92□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 HXT1YHR094C 1713 nt9.91□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 TOA2YKL058W 369 nt9.91□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 YGL114WYGL114W 2178 nt9.91□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 PHO23YNL097C 993 nt9.9□□□□□ -0.82
RTP1Q12751 GID7YCL039W 2238 nt9.9□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 RIM8YGL045W 1629 nt9.88□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 SAM3YPL274W 1764 nt9.88□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 MAS1YLR163C 1389 nt9.88□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 YPR126CYPR126C 309 nt9.87□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 BNI5YNL166C 1347 nt9.85□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 MSC1YML128C 1542 nt9.84□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 YCP4YCR004C 744 nt9.84□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 MCM5YLR274W 2328 nt9.84□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 MUP1YGR055W 1725 nt9.84□□□□□ -0.83
RTP1Q12751 CTI6YPL181W 1521 nt9.83□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.83□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 APS2YJR058C 444 nt9.82□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 IML3YBR107C 738 nt9.82□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 GND2YGR256W 1479 nt9.82□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 QDR2YIL121W 1629 nt9.82□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 POP2YNR052C 1302 nt9.82□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 DAK2YFL053W 1776 nt9.8□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 HOL1YNR055C 1761 nt9.8□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 SEC61YLR378C 1443 nt9.8□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 TPS1YBR126C 1488 nt9.79□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 OXA1YER154W 1209 nt9.78□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 NIF3YGL221C 867 nt9.78□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 ZRT3YKL175W 1512 nt9.77□□□□□ -0.84
RTP1Q12751 SAM2YDR502C 1155 nt9.77□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 OYE2YHR179W 1203 nt9.77□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 YNL024CYNL024C 741 nt9.77□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.76□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 ESBP6YNL125C 2022 nt9.75□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 SAM50YNL026W 1455 nt9.75□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 IGD1YFR017C 588 nt9.75□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 RAS2YNL098C 969 nt9.75□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 MAE1YKL029C 2010 nt9.75□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 UFO1YML088W 2007 nt9.74□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 SHY1YGR112W 1170 nt9.73□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 YER188WYER188W 720 nt9.72□□□□□ -0.85
RTP1Q12751 EAF3YPR023C 1206 nt9.71□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 FUB1YCR076C 753 nt9.7□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 HEM14YER014W 1620 nt9.7□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 YJL067WYJL067W 351 nt9.69□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 URA6YKL024C 615 nt9.69□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 KRE1YNL322C 942 nt9.69□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 OYE3YPL171C 1203 nt9.69□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 YCR025CYCR025C 411 nt9.68□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 BUD20YLR074C 501 nt9.66□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 TMA23YMR269W 636 nt9.66□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 IPL1YPL209C 1104 nt9.66□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 ACO2YJL200C 2370 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.65□□□□□ -0.86
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