Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 YAR028WYAR028W 705 nt10.54□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 ZTA1YBR046C 1005 nt10.54□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 GSF2YML048W 1212 nt10.53□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 YCR099CYCR099C 468 nt10.52□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 RPL12BYDR418W 498 nt10.52□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 GAP1YKR039W 1809 nt10.51□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 Q0142Q0142 177 nt10.51□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 DUS1YML080W 1272 nt10.5□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 AI3Q0060 1248 nt10.49□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 RTF1YGL244W 1677 nt10.49□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 YOR268CYOR268C 399 nt10.48□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 UTP6YDR449C 1323 nt10.48□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 PIB2YGL023C 1908 nt10.47□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 LCP5YER127W 1074 nt10.47□□□□□ -0.73
SRF1Q12516 MFG1YDL233W 1377 nt10.46□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 MTG2YHR168W 1557 nt10.46□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 CCA1YER168C 1641 nt10.46□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 snR78snR78 87 nt10.45□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 POT1YIL160C 1254 nt10.45□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 TOM20YGR082W 552 nt10.44□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 STR3YGL184C 1398 nt10.43□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.43□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 YOR343CYOR343C 327 nt10.43□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 ARP6YLR085C 1317 nt10.42□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 HOG1YLR113W 1308 nt10.42□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 YNR068CYNR068C 819 nt10.42□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 YCR025CYCR025C 411 nt10.4□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 ACO2YJL200C 2370 nt10.4□□□□□ -0.74
SRF1Q12516 MHF1YOL086W-A 273 nt10.39□□□□□ -0.75
SRF1Q12516 DIF1YLR437C 402 nt10.37□□□□□ -0.75
SRF1Q12516 SKG1YKR100C 1068 nt10.35□□□□□ -0.75
SRF1Q12516 UGA4YDL210W 1716 nt10.35□□□□□ -0.75
SRF1Q12516 RCR1YBR005W 642 nt10.34□□□□□ -0.75
SRF1Q12516 APS2YJR058C 444 nt10.33□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 HIF1YLL022C 1158 nt10.33□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 RIB7YBR153W 735 nt10.33□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 LSB5YCL034W 1065 nt10.33□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 IGD1YFR017C 588 nt10.32□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 YMR007WYMR007W 381 nt10.32□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 URH1YDR400W 1023 nt10.31□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 YPL071CYPL071C 471 nt10.31□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 HRA1HRA1 564 nt10.29□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 GAL3YDR009W 1563 nt10.29□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 Q0017Q0017 162 nt10.28□□□□□ -0.76
SRF1Q12516 PTK1YKL198C 1989 nt10.27□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 SWM1YDR260C 513 nt10.27□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 IPL1YPL209C 1104 nt10.27□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 YFL054CYFL054C 1941 nt10.27□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 SNZ1YMR096W 894 nt10.26□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 YJL118WYJL118W 660 nt10.25□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 YCL074WYCL074W 927 nt10.23□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 LYS20YDL182W 1287 nt10.23□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 CTI6YPL181W 1521 nt10.23□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 CSM1YCR086W 573 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.22□□□□□ -0.77
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SRF1Q12516 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.22□□□□□ -0.77
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SRF1Q12516 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 RPT5YOR117W 1305 nt10.22□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 SED1YDR077W 1017 nt10.21□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 NIF3YGL221C 867 nt10.21□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 IML3YBR107C 738 nt10.21□□□□□ -0.77
SRF1Q12516 PLB1YMR008C 1995 nt10.21□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 YGL188CYGL188C 174 nt10.2□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 NUC1YJL208C 990 nt10.19□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 YMR206WYMR206W 942 nt10.19□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 HMT1YBR034C 1047 nt10.19□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 YPL168WYPL168W 1293 nt10.19□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 URE2YNL229C 1065 nt10.18□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 YPR126CYPR126C 309 nt10.18□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 Q0255Q0255 1419 nt10.17□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 RTN2YDL204W 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.16□□□□□ -0.78
SRF1Q12516 GRH1YDR517W 1119 nt10.14□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.14□□□□□ -0.79
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SRF1Q12516 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.14□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 SDH8YBR269C 417 nt10.14□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 OYE3YPL171C 1203 nt10.13□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 YNL024CYNL024C 741 nt10.12□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 UTR1YJR049C 1593 nt10.11□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 YOR169CYOR169C 465 nt10.11□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 YGR259CYGR259C 441 nt10.09□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 SAM35YHR083W 990 nt10.09□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 AIR1YIL079C 1083 nt10.09□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 KTR3YBR205W 1215 nt10.09□□□□□ -0.79
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