Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rit1P70426 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rit1P70426 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rit1P70426 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rit1P70426 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rit1P70426 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rit1P70426 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rit1P70426 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rit1P70426 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rit1P70426 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rit1P70426 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rit1P70426 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rit1P70426 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rit1P70426 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rit1P70426 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rit1P70426 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rit1P70426 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rit1P70426 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rit1P70426 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms