Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tgif1P70284 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgif1P70284 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgif1P70284 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgif1P70284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgif1P70284 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgif1P70284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgif1P70284 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.7 ms