Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpnP63163 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpnP63163 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrpnP63163 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpnP63163 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpnP63163 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpnP63163 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpnP63163 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpnP63163 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms