Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp2c39P56656 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp2c39P56656 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp2c39P56656 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c39P56656 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c39P56656 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp2c39P56656 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp2c39P56656 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp2c39P56656 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp2c39P56656 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp2c39P56656 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms