Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn1P54254 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn1P54254 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn1P54254 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn1P54254 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn1P54254 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn1P54254 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn1P54254 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn1P54254 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn1P54254 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms