Protein–RNA interactions for Protein: P51676

Ccr1l1, C-C chemokine receptor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1l1P51676 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1l1P51676 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1l1P51676 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1l1P51676 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1l1P51676 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr1l1P51676 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1l1P51676 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1l1P51676 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1l1P51676 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccr1l1P51676 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1l1P51676 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1l1P51676 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms