Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HpdP49429 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HpdP49429 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HpdP49429 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HpdP49429 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HpdP49429 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HpdP49429 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HpdP49429 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HpdP49429 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HpdP49429 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HpdP49429 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HpdP49429 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HpdP49429 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HpdP49429 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HpdP49429 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HpdP49429 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HpdP49429 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HpdP49429 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HpdP49429 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HpdP49429 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HpdP49429 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HpdP49429 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HpdP49429 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HpdP49429 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HpdP49429 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HpdP49429 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HpdP49429 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HpdP49429 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HpdP49429 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HpdP49429 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HpdP49429 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HpdP49429 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HpdP49429 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HpdP49429 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HpdP49429 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HpdP49429 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HpdP49429 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpdP49429 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpdP49429 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpdP49429 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpdP49429 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpdP49429 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HpdP49429 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HpdP49429 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HpdP49429 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HpdP49429 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HpdP49429 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HpdP49429 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HpdP49429 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HpdP49429 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HpdP49429 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HpdP49429 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HpdP49429 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HpdP49429 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HpdP49429 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HpdP49429 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HpdP49429 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HpdP49429 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HpdP49429 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HpdP49429 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HpdP49429 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HpdP49429 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HpdP49429 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HpdP49429 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HpdP49429 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HpdP49429 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HpdP49429 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HpdP49429 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HpdP49429 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HpdP49429 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HpdP49429 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HpdP49429 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HpdP49429 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HpdP49429 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HpdP49429 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HpdP49429 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HpdP49429 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HpdP49429 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HpdP49429 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HpdP49429 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HpdP49429 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HpdP49429 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HpdP49429 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HpdP49429 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HpdP49429 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HpdP49429 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HpdP49429 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HpdP49429 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HpdP49429 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HpdP49429 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HpdP49429 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms