Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KdrP35918 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KdrP35918 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KdrP35918 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KdrP35918 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
KdrP35918 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KdrP35918 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KdrP35918 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KdrP35918 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KdrP35918 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KdrP35918 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KdrP35918 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
KdrP35918 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KdrP35918 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KdrP35918 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KdrP35918 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KdrP35918 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KdrP35918 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KdrP35918 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KdrP35918 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KdrP35918 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KdrP35918 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KdrP35918 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KdrP35918 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KdrP35918 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KdrP35918 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KdrP35918 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KdrP35918 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KdrP35918 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KdrP35918 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KdrP35918 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KdrP35918 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KdrP35918 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KdrP35918 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KdrP35918 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KdrP35918 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KdrP35918 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KdrP35918 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KdrP35918 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KdrP35918 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KdrP35918 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KdrP35918 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KdrP35918 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KdrP35918 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KdrP35918 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KdrP35918 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KdrP35918 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KdrP35918 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KdrP35918 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KdrP35918 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KdrP35918 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KdrP35918 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KdrP35918 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KdrP35918 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KdrP35918 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KdrP35918 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KdrP35918 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KdrP35918 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KdrP35918 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KdrP35918 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KdrP35918 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KdrP35918 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KdrP35918 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KdrP35918 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KdrP35918 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KdrP35918 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KdrP35918 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KdrP35918 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KdrP35918 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KdrP35918 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KdrP35918 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KdrP35918 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KdrP35918 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KdrP35918 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KdrP35918 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KdrP35918 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KdrP35918 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KdrP35918 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KdrP35918 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KdrP35918 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KdrP35918 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KdrP35918 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
KdrP35918 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KdrP35918 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KdrP35918 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KdrP35918 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KdrP35918 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KdrP35918 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KdrP35918 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KdrP35918 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KdrP35918 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KdrP35918 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KdrP35918 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KdrP35918 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KdrP35918 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms