Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DmdP11531 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DmdP11531 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DmdP11531 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DmdP11531 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DmdP11531 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DmdP11531 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DmdP11531 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DmdP11531 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DmdP11531 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DmdP11531 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DmdP11531 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DmdP11531 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DmdP11531 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DmdP11531 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DmdP11531 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DmdP11531 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DmdP11531 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DmdP11531 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DmdP11531 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DmdP11531 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DmdP11531 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DmdP11531 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DmdP11531 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DmdP11531 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DmdP11531 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DmdP11531 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DmdP11531 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DmdP11531 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DmdP11531 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DmdP11531 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DmdP11531 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DmdP11531 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DmdP11531 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DmdP11531 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DmdP11531 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DmdP11531 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DmdP11531 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DmdP11531 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DmdP11531 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DmdP11531 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DmdP11531 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DmdP11531 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DmdP11531 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DmdP11531 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DmdP11531 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DmdP11531 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DmdP11531 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DmdP11531 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DmdP11531 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DmdP11531 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DmdP11531 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DmdP11531 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DmdP11531 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DmdP11531 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DmdP11531 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DmdP11531 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DmdP11531 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DmdP11531 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DmdP11531 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DmdP11531 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DmdP11531 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DmdP11531 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DmdP11531 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DmdP11531 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DmdP11531 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DmdP11531 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DmdP11531 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DmdP11531 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DmdP11531 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DmdP11531 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DmdP11531 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DmdP11531 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DmdP11531 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DmdP11531 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DmdP11531 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DmdP11531 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DmdP11531 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DmdP11531 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DmdP11531 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DmdP11531 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DmdP11531 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DmdP11531 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DmdP11531 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DmdP11531 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DmdP11531 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DmdP11531 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DmdP11531 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DmdP11531 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DmdP11531 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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