Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01807 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01807 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01807 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01807 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01807 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
P01807 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01807 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
P01807 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01807 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
P01807 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01807 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01807 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
P01807 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
P01807 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01807 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01807 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01807 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01807 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01807 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01807 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01807 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01807 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01807 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01807 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01807 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01807 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01807 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01807 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01807 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01807 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01807 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01807 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01807 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01807 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01807 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01807 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01807 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01807 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01807 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
P01807 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01807 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01807 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01807 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01807 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01807 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
P01807 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01807 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01807 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01807 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
P01807 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01807 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01807 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01807 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01807 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01807 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01807 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01807 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01807 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01807 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01807 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01807 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01807 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01807 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01807 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01807 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01807 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01807 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01807 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01807 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P01807 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P01807 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01807 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01807 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
P01807 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01807 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01807 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01807 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
P01807 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01807 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
P01807 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01807 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01807 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01807 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01807 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01807 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01807 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01807 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01807 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
P01807 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01807 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01807 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01807 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01807 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01807 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
P01807 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
P01807 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01807 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01807 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01807 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms