Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip2G3XA57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip2G3XA57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip2G3XA57 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab11fip2G3XA57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab11fip2G3XA57 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab11fip2G3XA57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab11fip2G3XA57 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip2G3XA57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip2G3XA57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms