Protein–RNA interactions for Protein: G3X9P9

AF366264, MCG1048453, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AF366264G3X9P9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms