Protein–RNA interactions for Protein: F2Z493

Magea4, Melanoma antigen, family A, 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea4F2Z493 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Magea4F2Z493 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Magea4F2Z493 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Magea4F2Z493 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Magea4F2Z493 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Magea4F2Z493 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea4F2Z493 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea4F2Z493 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Magea4F2Z493 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms