Protein–RNA interactions for Protein: F2Z493

Magea4, Melanoma antigen, family A, 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea4F2Z493 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Magea4F2Z493 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Magea4F2Z493 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Magea4F2Z493 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Magea4F2Z493 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Magea4F2Z493 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Magea4F2Z493 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Magea4F2Z493 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Magea4F2Z493 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Magea4F2Z493 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Magea4F2Z493 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Magea4F2Z493 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Magea4F2Z493 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Magea4F2Z493 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Magea4F2Z493 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Magea4F2Z493 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Magea4F2Z493 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Magea4F2Z493 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Magea4F2Z493 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Magea4F2Z493 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Magea4F2Z493 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Magea4F2Z493 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Magea4F2Z493 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Magea4F2Z493 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Magea4F2Z493 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Magea4F2Z493 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Magea4F2Z493 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Magea4F2Z493 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Magea4F2Z493 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Magea4F2Z493 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Magea4F2Z493 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Magea4F2Z493 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Magea4F2Z493 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Magea4F2Z493 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Magea4F2Z493 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Magea4F2Z493 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Magea4F2Z493 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Magea4F2Z493 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Magea4F2Z493 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Magea4F2Z493 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Magea4F2Z493 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Magea4F2Z493 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Magea4F2Z493 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Magea4F2Z493 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Magea4F2Z493 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Magea4F2Z493 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Magea4F2Z493 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Magea4F2Z493 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Magea4F2Z493 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Magea4F2Z493 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Magea4F2Z493 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Magea4F2Z493 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Magea4F2Z493 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Magea4F2Z493 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Magea4F2Z493 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Magea4F2Z493 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Magea4F2Z493 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Magea4F2Z493 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Magea4F2Z493 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Magea4F2Z493 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Magea4F2Z493 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Magea4F2Z493 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Magea4F2Z493 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Magea4F2Z493 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Magea4F2Z493 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Magea4F2Z493 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Magea4F2Z493 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Magea4F2Z493 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Magea4F2Z493 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Magea4F2Z493 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Magea4F2Z493 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Magea4F2Z493 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Magea4F2Z493 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Magea4F2Z493 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Magea4F2Z493 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Magea4F2Z493 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Magea4F2Z493 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Magea4F2Z493 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Magea4F2Z493 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Magea4F2Z493 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Magea4F2Z493 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Magea4F2Z493 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Magea4F2Z493 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Magea4F2Z493 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Magea4F2Z493 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Magea4F2Z493 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Magea4F2Z493 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Magea4F2Z493 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Magea4F2Z493 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Magea4F2Z493 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Magea4F2Z493 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Magea4F2Z493 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Magea4F2Z493 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Magea4F2Z493 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Magea4F2Z493 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Magea4F2Z493 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Magea4F2Z493 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Magea4F2Z493 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Magea4F2Z493 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Magea4F2Z493 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms