Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2Z1

Cecr2, Cat eye syndrome critical region protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cecr2E9Q2Z1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Cecr2E9Q2Z1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Cecr2E9Q2Z1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Cecr2E9Q2Z1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Cecr2E9Q2Z1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Cecr2E9Q2Z1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Cecr2E9Q2Z1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Cecr2E9Q2Z1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Cecr2E9Q2Z1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Cecr2E9Q2Z1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
Cecr2E9Q2Z1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Cecr2E9Q2Z1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Cecr2E9Q2Z1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Cecr2E9Q2Z1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Cecr2E9Q2Z1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Cecr2E9Q2Z1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Cecr2E9Q2Z1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Cecr2E9Q2Z1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Cecr2E9Q2Z1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Cecr2E9Q2Z1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Cecr2E9Q2Z1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Cecr2E9Q2Z1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Cecr2E9Q2Z1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Cecr2E9Q2Z1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44.38■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Cecr2E9Q2Z1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms