Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm3095E9Q058 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm3095E9Q058 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm3095E9Q058 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm3095E9Q058 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm3095E9Q058 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm3095E9Q058 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm3095E9Q058 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3095E9Q058 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm3095E9Q058 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm3095E9Q058 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm3095E9Q058 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm3095E9Q058 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms