Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1E9PZ36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1E9PZ36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkhd1E9PZ36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkhd1E9PZ36 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkhd1E9PZ36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms