Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc144bE9PVZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc144bE9PVZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc144bE9PVZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms