Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
9630041A04RikD3Z3U4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
9630041A04RikD3Z3U4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
9630041A04RikD3Z3U4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
9630041A04RikD3Z3U4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
9630041A04RikD3Z3U4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9630041A04RikD3Z3U4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms