Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd7A2AJK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd7A2AJK6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd7A2AJK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd7A2AJK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd7A2AJK6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd7A2AJK6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd7A2AJK6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd7A2AJK6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd7A2AJK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd7A2AJK6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd7A2AJK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms