Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms