Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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PTPRKQ15262 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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PTPRKQ15262 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
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PTPRKQ15262 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
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PTPRKQ15262 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
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PTPRKQ15262 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
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PTPRKQ15262 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
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