Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM28Q13263 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM28Q13263 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM28Q13263 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM28Q13263 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM28Q13263 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM28Q13263 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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