Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 snR63snR63 255 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YLR339CYLR339C 552 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SUB1YMR039C 879 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 MIC27YNL100W 705 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RRD2YPL152W 1077 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 ARP8YOR141C 2646 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 HMO1YDR174W 741 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YDR222WYDR222W 1248 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YGL101WYGL101W 648 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YGL159WYGL159W 1113 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YGR293CYGR293C 462 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SRN2YLR119W 642 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YML037CYML037C 1023 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 IAH1YOR126C 717 nt2.74□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SWR1YDR334W 4545 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YNL011CYNL011C 1335 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 NHP10YDL002C 612 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RRG1YDR065W 1098 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 NSE3YDR288W 912 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YGL138CYGL138C 1038 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SOL3YHR163W 750 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YHR213WYHR213W 597 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RPC17YJL011C 486 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RPL8BYLL045C 771 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YAR062WYAR062W 597 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 ERV41YML067C 1059 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YBL096CYBL096C 309 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 MLH1YMR167W 2310 nt2.73□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 FAR11YNL127W 2862 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 STN1YDR082W 1485 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 KRE33YNL132W 3171 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 GIN4YDR507C 3429 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 TSC13YDL015C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 FIR1YER032W 2631 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 CIR1YGR207C 786 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 MCR1YKL150W 909 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 TFA2YKR062W 987 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 CDC123YLR215C 1083 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 BOI1YBL085W 2943 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SSP2YOR242C 1116 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YEF3YLR249W 3135 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 IRC3YDR332W 2070 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 DUG2YBR281C 2637 nt2.72□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 PAF1YBR279W 1338 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 ECM11YDR446W 909 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 ARI1YGL157W 1044 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 MST28YAR033W 705 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 RPS29AYLR388W 171 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 RPS1AYLR441C 768 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YNL035CYNL035C 1170 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 ATG3YNR007C 933 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YGL176CYGL176C 1665 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YBR259WYBR259W 2067 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YJR061WYJR061W 2808 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 NUF2YOL069W 1356 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 PBS2YJL128C 2007 nt2.71□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 SPF1YEL031W 3648 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YPL150WYPL150W 2706 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 IRA2YOL081W 9240 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 UTP15YMR093W 1542 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 OMA1YKR087C 1038 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 HRT3YLR097C 1035 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 COX14YML129C 213 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YOL057WYOL057W 2136 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 CAT5YOR125C 702 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 ATP3YBR039W 936 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YOR387CYOR387C 621 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 POS5YPL188W 1245 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 LTP1YPR073C 486 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 RRG8YPR116W 834 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 ORC1YML065W 2745 nt2.7□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YGR168CYGR168C 1131 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YIL161WYIL161W 708 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YKL066WYKL066W 444 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YOL114CYOL114C 609 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YSA1YBR111C 696 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YBT1YLL048C 4986 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 APC5YOR249C 2058 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 HAA1YPR008W 2085 nt2.69□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 GCD10YNL062C 1437 nt2.68□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.68□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 SDO1YLR022C 753 nt2.68□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 AVT5YBL089W 1380 nt2.68□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 RRP14YKL082C 1305 nt2.68□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 OTU2YHL013C 924 nt2.67□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 MBB1YJL199C 327 nt2.67□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 COA4YLR218C 453 nt2.67□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 SAS2YMR127C 1017 nt2.67□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 SEN54YPL083C 1404 nt2.67□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YHR078WYHR078W 1659 nt2.66□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 KHA1YJL094C 2622 nt2.66□□□□□ -1.98
RUD3Q12234 YCR015CYCR015C 954 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms