Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms