Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABCE1P61221 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms