Protein–RNA interactions for Protein: P40018

SMB1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMB1P40018 MUS81YDR386W 1899 nt2.62□□□□□ -1.99
SMB1P40018 FUN30YAL019W 3396 nt2.62□□□□□ -1.99
SMB1P40018 PSK1YAL017W 4071 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YOR296WYOR296W 3870 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 EAP1YKL204W 1899 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 SMX2YFL017W-A 234 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YGL138CYGL138C 1038 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 MPC3YGR243W 441 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 PPX1YHR201C 1194 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 AGE2YIL044C 897 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 GTT2YLL060C 702 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 MCT1YOR221C 1083 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YBR116CYBR116C 528 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 TFC4YGR047C 3078 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 ERG11YHR007C 1593 nt2.61□□□□□ -1.99
SMB1P40018 PUF6YDR496C 1971 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 DBP7YKR024C 2229 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 RGC1YPR115W 3252 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 BMH2YDR099W 822 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 MPS2YGL075C 1164 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 LAC1YKL008C 1257 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 DUG3YNL191W 1074 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 SSP2YOR242C 1116 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 SUT2YPR009W 807 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 snR42snR42 351 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 ARO4YBR249C 1113 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 NET1YJL076W 3570 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 INP52YNL106C 3552 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 BNI4YNL233W 2679 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 TOM1YDR457W 9807 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 HEH2YDR458C 1992 nt2.6□□□□□ -1.99
SMB1P40018 CEP3YMR168C 1827 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 CBP2YHL038C 1893 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 RIM1YCR028C-A 408 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 BRR6YGL247W 594 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 RGI2YIL057C 495 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 SPP381YBR152W 876 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YCK2YNL154C 1641 nt2.59□□□□□ -1.99
SMB1P40018 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 YCL019WYCL019W 5313 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 SST2YLR452C 2097 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 SLI1YGR212W 1407 nt2.59□□□□□ -2
SMB1P40018 RAD55YDR076W 1221 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 YPR1YDR368W 939 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 RTT105YER104W 627 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 FMP32YFL046W 624 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 RPL15AYLR029C 615 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 RPS10BYMR230W 318 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 ECM29YHL030W 5607 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 FLO11YIR019C 4104 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 BNA4YBL098W 1383 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 MAK5YBR142W 2322 nt2.58□□□□□ -2
SMB1P40018 RAX2YLR084C 3663 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 ENP2YGR145W 2124 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 MOT1YPL082C 5604 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 RNH202YDR279W 1053 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 NSA2YER126C 786 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 YJL175WYJL175W 513 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 YKL162CYKL162C 1209 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 SIC1YLR079W 855 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 YLR297WYLR297W 390 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 BET5YML077W 480 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 YNL203CYNL203C 612 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 GYP7YDL234C 2241 nt2.57□□□□□ -2
SMB1P40018 MED1YPR070W 1701 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 DTD1YDL219W 453 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 RRT13YER066W 558 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 RPB9YGL070C 369 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 CPR7YJR032W 1182 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 YKR033CYKR033C 426 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 NNT1YLR285W 786 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 YMR087WYMR087W 855 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 RPL33AYPL143W 324 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 RRP14YKL082C 1305 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 HBT1YDL223C 3141 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 APC5YOR249C 2058 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 YKL222CYKL222C 2118 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 CDC5YMR001C 2118 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 PAM1YDR251W 2493 nt2.56□□□□□ -2
SMB1P40018 ATP22YDR350C 2055 nt2.55□□□□□ -2
SMB1P40018 KRE2YDR483W 1329 nt2.55□□□□□ -2
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