Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms