Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOPBP1Q92547 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms