Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms