Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms