Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LEMD3Q9Y2U8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LEMD3Q9Y2U8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms