Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEFL1Q9UHV5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms